追蹤艦隊在古老組織殘余勢力的猛烈攻擊下，形勢愈發危急。多艘戰艦受損嚴重，部分已經失去戰斗力。但就在此時，追蹤艦隊的傳感器捕捉到了一個異常信號，經過分析發現，古老組織旗艦的能量護盾出現了短暫的不穩定。

“這是個機會！全體戰艦，集中所有火力，趁他們護盾不穩定，全力攻擊旗艦！”追蹤艦隊指揮官抓住這轉瞬即逝的機會，果斷下令。一時間，追蹤艦隊剩余的戰艦紛紛將最強火力傾瀉向古老組織的旗艦。旗艦在密集的炮火下劇烈顫抖，護盾最終不堪重負，轟然破碎。

古老組織旗艦的護盾破碎后，追蹤艦隊的攻擊更加猛烈。旗艦的外殼開始出現裂縫，內部系統也受到嚴重破壞。然而，古老組織似乎并不打算輕易放棄，他們啟動了旗艦上的自毀程序，試圖與追蹤艦隊同歸于盡。

“不好，他們要自毀，全體戰艦迅速撤離！”指揮官意識到危險，急忙下達撤退命令。追蹤艦隊的戰艦們拼盡全力，以最快速度遠離古老組織旗艦。就在艦隊剛剛撤離到安全距離時，旗艦發生了劇烈爆炸，強大的能量沖擊波向四周擴散開來，幸好追蹤艦隊及時逃脫，才未受到太大波及。

在追蹤艦隊與古老組織殘余勢力激戰的同時，科研團隊對結構體信息的解讀也迎來了關鍵轉機。他們成功破解了結構體中關于操控宇宙基本能量技術的核心部分。這項技術可以通過特定的能量頻率組合，實現對宇宙能量的精確操控，甚至有可能影響時空結構。

“如果我們能掌握這項技術，或許就能徹底阻止古老組織的瘋狂計劃。但我們需要時間來將理論轉化為實際應用。”科研團隊負責人說道。然而，時間緊迫，古老組織殘余勢力雖然遭受重創，但他們仍有可能在科研團隊完成技術轉化之前，利用神秘球體做出不可挽回的事情。

此時，追蹤艦隊在擊退古老組織殘余勢力后，迅速向科研團隊靠攏。他們帶來了從古老組織旗艦上獲取的一些關鍵數據，這些數據與科研團隊對結構體信息的研究相結合，有望加速技術的轉化進程。

但危機并未解除。在追蹤艦隊和科研團隊會合后，他們發現神秘球體的能量波動突然增強，似乎即將發生某種巨大的變化。古老組織是否在自毀旗艦前啟動了神秘球體的某些隱藏機制？追蹤艦隊和科研團隊能否在神秘球體引發災難前，成功掌握并運用操控宇宙基本能量的技術，化解這場危機？宇宙的命運在這轉機與危機激烈碰撞的關鍵時刻，再次陷入了極度的緊張與不確定之中，等待著聯盟去力挽狂瀾，拯救岌岌可危的宇宙。